Wissenschaftliche*r Projektmitarbeiter*in mit Diplom/Master im Beschäftigungsausmaß von 30 Wst. (befristet auf 3 Jahre)

1 Wissenschaftliche*r Projektmitarbeiter*in mit Diplom/Master imBeschäftigungsausmaß von 30 Wst. (befristet auf 3 Jahre) Organisationseinheit: Klinisches Institut für Pathologie und MolekularpathologieEintrittsdatum: 07.01.2027Anzeigennummer: 60900-2026-002133Unser Forschungsprojekt "Analysis of response to Immunotherapy in MSI tumors: Evaluation and Prediction of Response to Immunotherapy in Microsatellite Instable Carcinomas" untersucht die molekulare und zelluläre Heterogenität mithilfe modernster Multi-Omics, räumlicher Transkriptomik (Spatial Transcriptomics) und computergestützter Pathologie (Computational Pathology), um Erkenntnisse über Tumorbiologie, Therapieresistenz und die Entwicklung von Biomarkern zugewinnen.Das Projekt wird von einem interdisziplinären und internationalen Team aus Patholog*innen, Molekularbiolog*innenund Expert*innen für computergestützte Pathologie durchgeführt und bietet ein innovatives Umfeld für die translationale Krebsforschung.Wir suchen eine*n PhD-Kandidat*in mit fortgeschrittenen Programmier- und IT-Kenntnissen (Computational Expertise), um die Datenanalyse, -integration und Methodenentwicklung zu leiten.

Diese Rolle ergänzt unser bestehendes Team aus hochqualifizierten Molekularbiolog*innen und Laborant*innen und konzentriert sich auf computergestützte Pathologie, räumliche Omics-Analysen (Spatial Omics) und Bioinformatik für große, komplexe Datensätze.Ihre Aufgaben:º Entwicklung und Pflege robuster Bioinformatik- und Biostatistik-Pipelines º Integration und Analyse von RNA-, Protein- und Whole-Slide-Imaging-Datenº Leitung von Machine-Learning- und Deep-Learning-Ansätzen für die digitale Pathologieº Anwendung von In-situ-Multiomics-Plattformen auf der Datenseiteº Management von High-Performance-Computing-Workflows für Whole-Slide-Bilder º Zusammenarbeit in einem internationalen Netzwerk mit jährlichen Präsenztreffen º Dokumentation und Präsentation der Ergebnisse in internen Besprechungen, auf Konferenzen und inPublikationen Mitwirkung an der Lehre sowie an der Co-Betreuung von Studierendenº Etablierte digitale Pathologie-Workflows (z.

B. QuPath, Python) für Multiplex-Immunfluoreszenz, Segmentierung,Phänotypisierung und Analysen räumlicher Zellnachbarschaften; Machine-Learning-Klassifikatoren zur Unterteilungvon Gewebekompartimenten befinden sich bereits in der Entwicklungº Internationale Zusammenarbeit mit Teams der Sorbonne University (CRSA, SIRIC CURAMUS)º Enge Zusammenarbeit mit dem Clinical Research Institute Medical Artificial Intelligenceº Eigenständige wissenschaftliche Forschung im Rahmen des Projekts mit dem Ziel des Verfassens einerDissertation (PhD-Arbeit)Ihr Profil:º Abgeschlossenes Diplom- oder Masterstudium in Informatik, Lebenswissenschaften, Medizin oder einemverwandten Fachgebiet º Sehr gute Programmierkenntnisse und fundierte computergestützte Expertise in den Bereichen Bioinformatik,Statistik und Computational Pathology º Fähigkeit zur Zusammenarbeit in interdisziplinären Teams sowie zur effektiven Kommunikation auf Englisch ;Deutschkenntnisse auf Niveau B1 bzw. die Bereitschaft, Deutsch zu lernenUnser Angebot:º Auf Basis einer Vollzeitbeschäftigung (40 Wochenstunden) beträgt das monatliche Mindestgehalt € 3.776,10 brutto(14 x pro Jahr, KV-Einstufung B1)º Attraktiver Campus mit guter Verkehrsanbindungº Kontinuierliche, attraktive Bildungschancenº Moderne Forschungsinfrastrukturº Dynamisches Forschungsumfeldº Sport und Bewegung (USI)º u.v.m.Ende Bewerbungsfrist: 16.11.2026Im Sinne des Frauenförderungsplans der JKU Linz werden Frauen besonders ermutigt, sich zu bewerben, diese werden bei gleicher Qualifikation vorrangig aufgenommen.

Menschen mit Beeinträchtigung, welche zum "Kreis der begünstigt Behinderten" gehören, werden bei entsprechender Eignung besonders berücksichtigt.Platz für Ihre Zukunft? Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser Jobportal. Für inhaltliche Auskünfte steht IhnenUniv.-Prof.

Dr. Rup...